白薇在孤儿院建立临时医疗站，却发现受伤的孩子们体内都出现了暗物质寄生体。她强忍着治愈之力反噬的剧痛，将净化之光注入孩子体内，寄生体在光芒中发出婴儿啼哭般的尖啸。“这些寄生体在改写他们的基因链，” 她看着检测报告，瞳孔地震，“如果放任不管，整个现实世界的人类都会变成暗物质傀儡。”
萧诺在与暗物质飞鸟的战斗中，邪神意识残留彻底失控。黑雾完全包裹他的身体，风元素化作暗物质飓风席卷城市。小满不顾危险冲入飓风，星轨轮盘与机械表同时爆发出耀眼光芒。“萧诺，还记得我们的约定吗？” 她的声音穿透呼啸的风声，“你说过要陪我看遍星轨世界的每一场流星雨！” 在她的呼唤下，黑雾中伸出一只手，紧紧握住她的手。
关键时刻，小满发现暗物质锁链的能量源头并非副院长，而是位于界隙核心的一个巨型晶体矩阵。这个矩阵由十二座暗物质高塔组成，每座高塔顶端都镶嵌着与副院长胸口相同的晶体。“原来如此，副院长只是个傀儡！” 她将发现共享给伙伴，“真正的幕后黑手，是在操控整个晶体矩阵！”
众人决定兵分三路：小满和萧诺潜入界隙核心摧毁晶体矩阵；顾言和苏璃负责切断地面的能量传输管道；白薇则留守现实世界，阻止暗物质寄生体的扩散。当小满和萧诺穿过界隙裂缝时，时间与空间的概念彻底扭曲，他们的身体在暗物质流中若隐若现。
在界隙核心，巨大的晶体矩阵散发着令人窒息的压迫感，每一座高塔都连接着不同维度的黑暗空间。副院长的虚影出现在矩阵中央，他的身体正在与晶体融合：“你们以为能阻止得了吗？‘隙核之主’的意志，是整个宇宙都无法抗拒的！” 随着他的话音，十二座高塔同时亮起，无数暗物质守卫从虚空中涌出。
小满举起星轨轮盘，十二星宫虚影在暗物质的侵蚀下艰难显现；萧诺凝聚起最后的风元素，风刃中掺杂着他的灵魂之力。他们知道，这一战，不仅关乎星轨世界与现实世界的存亡，更将揭开隐藏在界隙深处的终极阴谋。而在晶体矩阵的最深处，一双散发着猩红光芒的眼睛，正注视着他们的一举一动 。
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